Bioquímica (s)em rede

Como se chega à Bioquímica 3D?

É normal e consensual reservar aos Docentes a busca de respostas para questões como estas. Felizmente, esta normalidade estende-se hoje em dia a cada estudante, capaz de realizar as suas buscas na web ou usufrutir de CDs disponibilizados como apoio a livros de texto.

Tanto na web como nos CDs de textos de referência internacionais de Bioquímica, podem encontrar-se gráficos moleculares a 3 Dimensões e animações dos mesmos. O Software necessário é gratuito e existe em 4 versões:
1. RasMol - comece em http://www.umass.edu/microbio/rasmol/ e faça o download do software em http://www.bernstein-plus-sons.com/software/rasmol/

2. Chime - a aplicação "CHIME" obtem-se, após registo, em:
http://www.mdli.com/products/framework/chemscape/ - depois de instalada não percam a página de BQ da Universidade do Kansas:
http://www.kumc.edu/research/medicine/biochemistry/bioc800/

3. MAGE - obtem-se em http://kinemage.biochem.duke.edu/software/softdownphp/downmage.php

4. pdbviewer - de http://www.expasy.org/spdbv/text/download.htm

A 3 Dimensões as proteínas e as moléculas mais pequenas, ganham novos aspectos fascinantes. Felizmente, podemos usufruir deles, gratuitamente e com muito pouco esforço.

MJ COsta

Descobri este blog no Congresso, e como adepto de blogs a curiosidade foi imediata. Só posso dar os parabéns pela iniciativa.

Exemplos já existiam de qualquer coisa parecida com um blog que serviria para discutir assuntos relacionados com a bioquimica e assuntos "off-topic", refiro-me claro ao site http://www.bioquimica.online.pt. Podemos facilmente ver que as discussões mais centradas em problemas ciêntificos têm pouca adesão (por isso não desanime com o volume, ainda baixo, de comentários neste blog).
Um blog quanto a mim tem vantagens: é mais fácil de gerir, design simples, fácil de interagir. E depois pelo facto de ter sido criado por um professor, adiciona-lhe um ponto (ou mais) a favor, quando comparamos este tipo de discussões. É como ter uma rede quando estamos no trapezio.

Relativamente ao tópico, parece-me óbvio que o 3d é muito aliciante e apelativo para os alunos (quiçá para todos). Facilita o tal pensamento abstracto, que tanto ouvimos falar nas aulas de organica, quando eramos aconselhados a imaginar as reacções a 3D para melhor entender um ataque nucleofilico aqui e não ali. Falando de estruturas "biológicas", quem não gosta de ver aquelas representações cheias de cores? A simulação do comportamento de determinada proteina em solução? É como ver a Proteína a dançar. Claramente são abordagens muito positivas.

Agora pegando numa das pontas que MJMatos deixou de fora. Acho que seria uma boa discussão neste blog a temática de "bolonha". O que é bolonha? para que serve? será que serve? implicações nos já licenciados? implicações nos futuros licenciados? implicações nas pós-graduações? implicações na qualidade de ensino? implicações no nivel dos trabalhos ciêntificos?

"Ora Tomem Lá"

Dei um salto ao outro blog (Que universidade?) e vi que já discutia a temática "Bolonha". De qualquer forma sem querer duplicar discussões, e podendo estar a fazê-lo,a sugestão para o universo "Bioquimica (s)em rede" mantém-se.

"Ora Tomem Lá"

Obrigado pela participação. Relativamente a Bolonha, não tenciono ser eu a iniciar essa discussão neste blogue, já que o "Que Universidade?" está para aí virado. Mas não o vou evitar. Se alguém abordar o tema nos comentários ou enviar um texto para publicação, concerteza que darei seguimento à discussão. Este blogue foi criado como um espaço virtual para ser partilhado, e cuja "personalidade" não dependerá exclusivamente de mim. Aqui, sou mais um "facilitador".

Em adição ao que disse anteriormente, talvez não seja má ideia que a temática de Bolonha seja aqui abordada. O "Que universidade?" e os restantes blogues da "blogoESfera" parecem não atrair estudantes, o que é uma pena. Se este blogue puder servir para isso, como já disse, não me oponho. Vou até ir um pouco mais longe, colocando uma entrada "provocatória" como teste.